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表觀遺傳學及DNA甲基化數據分析專題班通知
點擊次數:11900 發布日期:2019-8-15  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
各有關單位:
表觀遺傳學是研究基因的核苷酸序列不發生改變的情況下,基因表達的可遺傳的變化的一門遺傳學分支學科。隨著實驗技術的進步,產生了海量的表觀基因組數據,從這些數據中挖掘生物學特征對理解生命的生理及病理過程有重要意義。面對海量的數據包括DNA甲基化譜、組蛋白修飾譜、核小體定位信息,研究人員開發了針對不同數據的分析工具和策略,理解和掌握表觀基因組數據的分析方法,為推動表觀遺傳學在各學科領域應用及發展,更好地促進專家學者們在研究中的分享和交流,由中科成創(北京)生物技術有限公司舉辦“表觀遺傳學及DNA甲基化數據分析”專題班,具體事宜通知如下:
 
一、培訓目標及特點:
本次培訓班邀請在表觀遺傳前沿技術方面有杰出貢獻的專家和學者向我們提供精彩實用的培訓內容,涵蓋多個熱門領域尖端研究技術,指導課題設計,分享寶貴經驗,并介紹本領域的最新動態和進展,與大家共同探討表觀遺傳學研究的課題設計思路和未來發展方向。
通過理論和實踐有機的相結合,對表觀遺傳學基本理論和基本技術的講解,使學員們深入了解DNA甲基化、組蛋白修飾、非編碼RNA等的知識以及相關的數據產生的各種高通量實驗技術與數據挖掘。
二、培訓對象:
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫學、化學、農學、計算機科學、數學類專業的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員;科研單位從事表觀遺傳學、DNA甲基化、組蛋白修飾等方面數據分析的技術人員領導與技術骨干。
三、授課專家:
主講專家來自中科院及高校等科研機構的高級專家,擁有豐富的科研工作經驗,長期從事表觀遺傳學、DNA甲基化、非編碼RNA、組蛋白修飾方面的項目研究,發表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術底蘊和專業背景,目前承擔國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。
四、時間地點:2019年9月27日-9月30日  四川  成都  (時間安排:第1天報到,授課3天)
五、培訓內容:
第一天上午
表觀遺傳學研究內容及思路,DNA甲基化原理、應用及研究
1. 表觀遺傳學研究內容及調控機制。
2. 通過近期Cell文章掌握表觀多組學研究思路。
3. 高通量測序技術概述。
4. 表觀遺傳學各組學測序技術及分析內容。
5. DNA甲基化理論:作用機制及研究應用。
理論
第一天下午
Linux及R語言實操,DNA甲基化數據分析
1. 常規基礎Linux命令入門講解及實操訓練。
2. R語言簡介及安裝,RStudio的安裝及使用說明。
3. R語言語法介紹及常用命令。
4. DNA甲基化測序數據分析(bismark,methylKit等軟件)。
5. DNA甲基化芯片數據分析(IMA等軟件)。
實操
第二天上午
組蛋白修飾及ATAC測序技術、分析思路及流程
 
1. 組蛋白修飾的研究方法及技術發展。
2. 組蛋白修飾的研究內容及科研思路。
3. 組蛋白修飾數據的分析流程及繪圖。
4. 組蛋白和多組學數據的整合分析。
理論
第二天下午
組蛋白修飾及ATAC數據分析
 
1. 利用fastqc、cutadapt及Trimmomatic對原始數據進行質控。
2. 通過bowtie2、bwa等軟件進行基因組mapping。
3. 通過MACS2軟件進行peak calling。
4. 利用HOMER軟件進行peak注釋及motif分析。
5. 調用R語言包Diffbind進行差異peaks分析。
實操
第三天上午
非編碼RNA、表觀轉錄組研究內容及思路
1. 轉錄組數據分析內容及思路介紹。
2. 長非編碼RNA、microRNA及circRNA的研究方法及思路。
3. 轉錄組多組學整合分析思路和案例介紹。
4. 表觀轉錄組學研究內容及多組學整合思路。
5. 組學分析常用數據庫介紹及使用。
理論
第三天下午
mRNA及非編碼轉錄組分析:定量、差異、功能富集及網絡
 
1. 通過tophat2、hisat2軟件進行轉錄組數據mapping。
2. 通過HTSeq及featureCounts進行基因表達定量。
3. 通過Deseq2,edgeR等R語言包進行差異表達分析。
4. 應用DAVID及metascape網站進行通路富集分析。
5. 箱型圖,熱圖,網絡圖,GO、KEGG富集圖,GSEA等圖形繪制。
實操
 
五、報名辦法及費用: 
每人¥3980元(含報名費、培訓費、資料費、上機費等)
團隊報名:4+1優惠。(5位其中1位免除費用)
所報名參加學員贈送一個8G U盤(內含上課所有使用軟件與課件資料)
食宿可統一安排,費用自理。各單位人員報名參加,報名回執表請回傳至會務處即可。
如單位有內訓需求,請將內訓方案傳至會務組,根據單位需求安排相應專家進行授課
 
中科成創(北京)生物技術有限公司
二零一九年八月十四日   
 
六、 聯系方式:                                   
聯系人:張琦  177 4456 9660                                  
報名郵箱:[email protected]    
 
參考附件:報名回執表.doc
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